熟练掌握计算机辅助药物设计软件:Sybyl,并用此软件导入咪唑并吡啶类ATX抑制剂,进行结构和能量优化,选择相应的training和test集合,从而构建符合要求的3D-QSAR模型。
题目:咪唑并吡啶类ATX抑制剂的3D-QSAR模型研究
学生姓名: 学号: 1410700405 专业:制药工程
任务起至日期: 2017 年 12 月 19 日至 2018 年 6 月 3 日 共 18 周
一、 课题的任务内容:
研究表明ATX蛋白与人类癌症、纤维化疾病和炎症等疾病有关,其靶向抑制剂是药物化学研究的热点。了解ATX抑制剂的研究状况,筛选有活性的分子。在此,我们需要熟练掌握计算机辅助药物设计软件:Sybyl,并用此软件导入咪唑并吡啶类ATX抑制剂,进行结构和能量优化,选择相应的training和test集合,从而构建符合要求的3D-QSAR模型。这为进一步设计并合成新型ATX抑制剂提供了理论依据,具有重要的意义。
二、原始条件及数据:
34个咪唑并吡啶类ATX抑制剂结构与其对应的IC50值。
三、设计的技术要求(论文的研究要求):
熟练掌握计算机辅助药物设计软件:Sybyl,并用此软件导入咪唑并吡啶类ATX抑制剂,进行结构和能量优化,选择相应的training和test集合,从而构建符合要求的3D-QSAR模型。
四、毕业设计(论文)应完成的具体工作:
构建ATX抑制剂的3D-QSAR模型。
软硬件名称、内容及主要的技术指标(可按以下类型选择):
计算机软件 SYBYL、Origin、Discovery Studio
图 纸 无
电 路 板 无
机 电 装 置 无
新材料制剂 无
结 构 模 型 无
其 他 无
五、查阅文献要求及主要的参考文献:
在导师指导下阅读相关英文文献5-8篇,中文文献2-4篇,并能较系统地总结;
能将一篇大于5000字的英文文献翻译成中文。
Castagna D., Duffy E. L., Semaan D., Young, L.C., Pritchard J.M., MacDonald S. J. F., Budd D.C., Jamieson C., Watson A.J.B.; Identification of a novel class of autotaxin inhibitors through cross-screening[J]. Med.Chem.Comm. 2015,6, 1149−1155.
Ashek A., Lee C., Park H., Cho S.J.; 3D-QSAR studies of dioxins and dioxin-like compounds using CoMFA and CoMSIA[J]. Chemosphere, 2006, 65(3): 521-529.
Nakai Y., Ikeda H., Nakamura K.; Specific increase in serum autotaxin activity in patients with pancreatic cancer[J]. Clin. Biochem. 2011,44(8-9): 576-581.
六、进度安排:(设计或论文各阶段的要求,时间安排):
第1-3周,熟悉课题,完成开题报告。 第4-15周,安装并熟练掌握计算机辅助药物设计软件:Sybyl,并用此软件导入咪唑并吡啶类ATX抑制剂,进行结构和能量优化,选择相应的training和test集合,从而构建符合要求的3D-QSAR模型。 第16-18周,整理数据,完成毕业论文。