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相比之下，nif基因被发现在许多细菌中存在。在大豆固氮菌中，研究最多的固氮基因是nif H和nif D[9]。在固氮生物的进化历程中，其编码固氮酶铁蛋白成分
相比之下，nif基因被发现在许多细菌中存在。在大豆固氮菌中，研究最多的固氮基因是nif H和nif D[9]。在固氮生物的进化历程中，其编码固氮酶铁蛋白成分的基因nif H核苷酸序列具有高度良好的保守性，它常常用来证明固氮菌的存在[10]。
在细菌基因组中，编码16S rRNA 的 rDNA 基因具有较强的保守性，片段大小适宜检测，所以一直成为细菌分子鉴定的标准序列，但是由于16S rRNA序列的高度保守性，使它在种属以下的分类水平具有很大的不稳定性；而亲缘关系在种属以上分类水平的菌株具有非常良好的分辨率[11]。所以，16S rDNA全序列的分析在分类学的地位上具有非常明显优势。
本研究对周口师范学院试验田中的大豆进行根瘤菌的分离纯化和回接实验，并且根据已经公布的大豆根瘤菌共同结瘤基因nod A，nif H，16S rDNA保守区域设计引物，从分子水平进一步鉴定分离的根瘤菌，并对nod A、nif H、16S rDNA序列构建系统发育树分析，以期对周口的大豆根瘤菌资源的丰富和系统分类地位提供研究的科学依据。