人源SEPT2蛋白不同单体高级结构建模与功能分析(2)

Septin2定位于2q37染色体上,该染色体与奥尔布赖特遗传性骨营养不良症样综合征有关,此病症的特点是在婴儿期表现出弱的肌肉张力,轻度到重度智力残疾


Septin2定位于2q37染色体上,该染色体与奥尔布赖特遗传性骨营养不良症样综合征有关,此病症的特点是在婴儿期表现出弱的肌肉张力,轻度到重度智力残疾和发育迟缓,行为问题,特征性面容和其他身体异常[11]。一些患者有罕见的肾癌,被称为肾母细胞瘤,一部分患者则表现为大脑,消化系统,肾脏畸形或生殖器受到影响[11]。

利用生物信息学分法预测蛋白质分子表面配体结合区域,研究其与药物小分子或蛋白质之间的互作,为合理药物分子设计提供帮助,同时也可以揭示蛋白质分子的功能。本研究以生物信息学方法对人SEPT2蛋白亚家族进行序列特征分析、进化分析、高级结构分析,旨在通过结构了解其功能,并为治疗与SEPT2蛋白有关的人类疾病提供理论基础。

1 材料和方法

1.1 数据来源

从GenBank蛋白质数据库中查询下载septin2的相关蛋白序列。

1.2 SEPT2蛋白序列的理化性质分析

利用Protparam在线工具预测SEPT2蛋白序列的氨基酸构成、理论等电点、分子质量、消光系数、脂肪指数、总平均亲水性等。

1.3基因结构比较

利用GenScan在线服务器,预测SEPT2蛋白的基因结构。

1.4 磷酸化位点分析

利用NetPhos 2.0 Server软件预测SEPT2蛋白的丝氨酸磷酸化、苏氨酸磷酸化以及酪氨酸磷酸化三种磷酸化作用位点。