摘  要：本文通过对小桐子JcDHN-1基因的生物信息学分析，对其蛋白的保守域分析、理化性质分析、亚细胞定位分析、跨膜区和前导肽分析、磷酸化位点分析、同源分析和系统发育分析等，预测其相关功能的生物学信息。结果表明，JcDHN-1蛋白位于细胞质中，具体为何蛋白还需进一步分析，其蛋白序列相对保守，蛋白长度相差不大，等电点在各物种之间差异极小，20种氨基酸在不同物种间分布较相似。这些结果为为小桐子的研究开发提供了一定的理论基础。

关键词：小桐子；JcDHN-1基因；生物信息分析

Bioinformatic Analysis of the JcDHN-1 gene in Jatropha Curcas

Abstract:  This study through to the jatropha curcas of tung tree JcDHN - 1 gene bioinformatics analysis, for its conservative protein domain analysis, physical and chemical properties, the subcellular localization analysis, across the membrane area and the leader peptide, phosphorylation sites, cognate analysis and phylogenetic analysis, forecast the related features of biological information. The results showed that the protein JcDHN - 1 is located in the cytoplasm, why specific protein still need further analysis, the relatively conservative protein sequences, protein length were similar, 20 kinds of amino acids in different species distribution is similar. To provide a theoretical basis for these results for the research and development of Jatropha curcas.

Key Words：Jatropha Curcas; JcDHN-1 gene; bioinformatic analysis

目    录

摘  要 1

Abstract: 1

引言 1

1小桐子的简介 1

2研究概况 2

3小桐子基因研究的目的与意义 3

4结果与分析 3

4.1 JcDHN-1基因的确认与分析 3

4.1.1 JcDHN-1基因的确认 3

4.1.2 J. curcas dehydrin cDNAs序列分析 3

4.1.3 JcDHN-1保守区的分析   5

4.1.4 JcDHN-1基因基本理化性质分析 5

4.1.5 JcDHN-1基因信号肽分析 6

4.1.6 JcDHN-1跨膜区域的分析 6

4.1.7 JcDHN-1基因磷酸化位点分析 7

4.1.8 JcDHN-1基因二级结构预测 7

4.2小桐子及其他物种DHN基因成员及相关信息 8

4.3小桐子DHN蛋白保守性分析 9

4.4小桐子DHN基因家族的系统发育分析 10

4.5 小桐子DHN蛋白同源性分析 10

5 讨论与展望 11

参考文献 13

致谢 13

小桐子JcDHN-1基因生物信息学分析

   引言

小桐子的发展潜力极大，它的种子含油率极高，经加工后可以制成生物柴油，而且油滤渣可以重新回收，制成生物饲料，也可做成有机生物肥料。小桐子每年的销量都非常巨大，各国都在大力开发小桐子的种植与生产。

1小桐子的简介

小桐子（Jatropha carcas），又名麻风树、老胖果、油卢子等。荨麻科，麻风树属，是一种常绿乔木。叶互生，近圆形至卵状圆形；花为单性，腋生或顶生；果实为核果或蒴果，稀浆果状；种子常有种阜，子叶宽扁，稀卷叠。广泛分布于南北纬度30度之间，被许多国家种植。原产于热带美洲，在中国主要分布于福建、海南、台湾等省份，现以云贵川地区为多[1]。

小桐子一般生长在河谷荒坡上，喜光，根系发达，生长迅速，生命力强，具有很强的繁殖能力。落叶易腐不易燃，改良土壤的能力较强[2]。可以形成良好的生物防火隔离带，可以再条件恶略的地方种植，是防沙化﹑改良土壤的主要树种。此外，小桐子还多为药用栽培植物，以树皮、果实等入药，有下泻、抗癌等功效；也可用于治疗跌打肿痛、麻风、关节挫败等外伤。

小桐子果实的含油量为60-70%，因此，改良后的树油可应用于各种柴油发动机，而且一氧化碳、硫排放等都较低，是具有潜力的油料作物[3-4]。而它的果实富含氮磷元素，也可以做有机肥使用。其叶、茎、皮所挤出的白色乳剂内含有毒蛋白、氰氢酸、酮类等成分；而在其果仁内，含有大量油脂、蛋白质、萜类、酮类、醇类及多种氨基酸等物质[5]。