番茄GDSL脂肪酶家族基因的序列特征与进化分析(3)

SlGDSL8Solyc01g098650.2 SlGDSL43Solyc04g007570.1SlGDSL78Solyc09g008690.1 SlGDSL9Solyc01g099010.2SlGDSL44Solyc04g024840.2SlGDSL79Solyc09g009700.2 SlGDSL10Solyc01g099020.2SlGDSL45Solyc04g028470.1SlGDSL8


SlGDSL8 Solyc01g098650.2 SlGDSL43 Solyc04g007570.1 SlGDSL78 Solyc09g008690.1

SlGDSL9 Solyc01g099010.2 SlGDSL44 Solyc04g024840.2 SlGDSL79 Solyc09g009700.2

SlGDSL10 Solyc01g099020.2 SlGDSL45 Solyc04g028470.1 SlGDSL80 Solyc09g030370.2

SlGDSL11 Solyc01g099030.2 SlGDSL46 Solyc04g050570.2 SlGDSL81 Solyc09g063060.2

SlGDSL12 Solyc01g099040.2 SlGDSL47 Solyc04g050730.2 SlGDSL82 Solyc10g008710.2

SlGDSL13 Solyc01g099050.2 SlGDSL48 Solyc04g081760.2 SlGDSL83 Solyc10g008720.2

SlGDSL14 Solyc01g099060.1 SlGDSL49 Solyc04g081770.2 SlGDSL84 Solyc10g008810.2

SlGDSL15 Solyc01g099080.2 SlGDSL50 Solyc04g081780.2 SlGDSL85 Solyc10g008820.2

SlGDSL16 Solyc01g100930.2 SlGDSL51 Solyc04g081790.2 SlGDSL86 Solyc10g008830.2

SlGDSL17 Solyc01g108640.1 SlGDSL52 Solyc04g081800.1 SlGDSL87 Solyc10g076740.1

SlGDSL18 Solyc01g109020.1 SlGDSL53 Solyc05g013680.2 SlGDSL88 Solyc10g085170.1

SlGDSL19 Solyc01g111960.2 SlGDSL54 Solyc05g013690.2 SlGDSL89 Solyc10g085740.1

SlGDSL20 Solyc02g065710.1 SlGDSL55 Solyc05g043320.1 SlGDSL90 Solyc11g006250.1

SlGDSL21 Solyc02g071610.2 SlGDSL56 Solyc05g043330.2 SlGDSL91 Solyc11g007180.1

SlGDSL22 Solyc02g071620.2 SlGDSL57 Solyc05g050210.2 SlGDSL92 Solyc11g011110.1

SlGDSL23 Solyc02g071690.1 SlGDSL58 Solyc06g007490.1 SlGDSL93 Solyc11g013870.1

SlGDSL24 Solyc02g071700.2 SlGDSL59 Solyc06g048670.2 SlGDSL94 Solyc11g031960.1

SlGDSL25 Solyc02g071710.2 SlGDSL60 Solyc06g051720.2 SlGDSL95 Solyc11g032050.1

SlGDSL26 Solyc02g071720.2 SlGDSL61 Solyc06g064820.2 SlGDSL96 Solyc11g032060.1

SlGDSL27 Solyc02g077120.2 SlGDSL62 Solyc06g064960.2 SlGDSL97 Solyc11g043110.1

SlGDSL28 Solyc02g077220.2 SlGDSL63 Solyc06g064970.2 SlGDSL98 Solyc11g051060.1

SlGDSL29 Solyc02g077330.2 SlGDSL64 Solyc06g064980.2 SlGDSL99 Solyc11g066700.1

SlGDSL30 Solyc02g077340.1 SlGDSL65 Solyc06g064990.2 SlGDSL100 Solyc11g072040.1

SlGDSL31 Solyc02g083160.1 SlGDSL66 Solyc06g065010.2 SlGDSL101 Solyc12g010560.1

SlGDSL32 Solyc02g090210.2 SlGDSL67 Solyc06g065530.2 SlGDSL102 Solyc12g017460.1

SlGDSL33 Solyc02g093500.2 SlGDSL68 Solyc06g071510.2 SlGDSL103 Solyc12g049550.1

SlGDSL34 Solyc03g005900.2 SlGDSL69 Solyc06g073100.2 SlGDSL104 Solyc12g089350.1

SlGDSL35 Solyc03g005910.2 SlGDSL70 Solyc06g083650.2 SlGDSL105 Solyc12g096620.1

3.2 番茄GDSL基因家族的系统进化关系

为了了解番茄植物的GDSL脂肪酶的基因家族的系统进化关系,本次研究将根据基因的结构域的不同对番茄的GDSL基因家族的105个成员(表1)进行分类,并构建进化树(图1)。由图1我们可以得知:GDSL家族基因共分为九大类群,并分别对其命名为GroupA、GroupB、GroupC、GroupD、GroupE、GroupF、GroupG、GroupH、和GroupI。从进化树图中我们可以得知,GroupA中含有17个番茄GDSL基因(如进化树上所示)和1个拟南芥的ARAB-1,说明拟南芥ARAB-1和番茄的这17个基因隶属于同一个分支,并具有相似性;GroupB中含有10个番茄GDSL基因(如进化树上所示),还有2个拟南芥基因,分别是FXG1和3G62280.1;GroupC含有5个番茄GDSL基因(如进化树上所示),没有拟南芥基因;GroupD共含有2个番茄GDSL基因(如进化树上所示)和1个拟南芥的5G03610.1基因;GroupE含有10个番茄GDSL基因和7个拟南芥基因(如进化树上所示);GroupF含有1个番茄GDSL基因和1个拟南芥基因(如进化树上所示);GroupG含有25个番茄GDSL基因和4个拟南芥基因(如进化树上所示);GroupH含有14个番茄GDSL基因和1个拟南芥基因(如进化树上所示);GroupI含有21个番茄GDSL基因和2个拟南芥基因(如进化树上所示)。综上所述可知,在这个进化树上不只有番茄的GDSL基因,含有拟南芥的不同类型的基因,番茄的GDSL脂肪酶基因进化并不是单独存在的,它的进化与其他植物的基因是有关系的。我们大胆猜想在同一类群中的基因具有相似性和同源性,在对植物的生长发育过程中的同一生理反应起着相同的作用。在这九个进化分支中含有的基因种类和个数各不相同,说明伴随着历史长河的流逝,受各种外部环境和植物内部生理因素的影响,基因也向着对植物生长发育有利的方向进行选择性的进化[12]。