1. 2. 7 肠道组织DNA提取 使用DNA提取试剂盒提取肠道组织的DNA。 1. 2. 8 肠道组织PCR扩增鉴定球虫种类 将所提取到的肠道组织DNA按不同部位、不同时间段分组
1. 2. 7 肠道组织DNA提取
使用DNA提取试剂盒提取肠道组织的DNA。
1. 2. 8 肠道组织PCR扩增鉴定球虫种类
将所提取到的肠道组织DNA按不同部位、不同时间段分组用7种球虫的特异性引物(见表1)进行PCR扩增。
十二直肠:感染1组(29h、36h、48h、60h、70h、72h、76h、88h、90h)
感染2组(96h、100h、108h、125h、144h、168h、192h、216h、240h)
空白对照组(29h、48h、70h、76h、90h、100h、144h、192h、240h)
小肠中段:感染1组(29h、36h、48h、60h、70h、72h、76h、88h、90h)
感染2组(96h、100h、108h、125h、144h、168h、192h、216h、240h)
空白对照组(29h、48h、70h、76h、90h、100h、144h、192h、240h)
小肠后段:感染1组(29h、36h、48h、60h、70h、72h、76h、88h、90h)
感染2组(96h、100h、108h、125h、144h、168h、192h、216h、240h)
空白对照组(29h、48h、70h、76h、90h、100h、144h、192h、240h)
盲肠盲端:感染1组(29h、36h、48h、60h、70h、72h、76h、88h、90h)
感染2组(96h、100h、108h、125h、144h、168h、192h、216h、240h)
空白对照组(29h、48h、70h、76h、90h、100h、144h、192h、240h)
直肠:感染1组(29h、36h、48h、60h、70h、72h、76h、88h、90h)
感染2组(96h、100h、108h、125h、144h、168h、192h、216h、240h)
空白对照组(29h、48h、70h、76h、90h、100h、144h、192h、240h)
每组各取肠道组织DNA 10μL于1.5mL的EP管,充分混合,即为该组的肠道DNA。
分装为25μL的体系,每一体系含有12.5μL扩增酶mix、4μL肠道DNA、上下游引物各1μL、6.5μL双蒸水补足反应体系。所使用的引物见下图
表1 球虫鉴定用PCR扩增引物
Table 1 The primers of PCR amplification
球虫种类 ITS1特异性扩增引物序列(5’-3’) 扩增的碱基片段大小 退火温度
堆型艾美耳球虫 AATTTAGTCCATCGCAACCCT
CGAGCGCTCTGCATACGACA 145bp 65℃
布氏艾美耳球虫 TACATCCCAATCTTTGAATCG
GGCATACTAGCTTCGAGCAAC 310bp 45℃
巨型艾美耳球虫 GTGGGACTGTGGTGATGGGG
ACCAGCATGCGCTCACAACCC 205bp 65℃
和缓艾美耳球虫 GGCTTGGATGATGTTTGCTG
CGAACGCAATAACACACGCT 330bp 65℃
毒害艾美耳球虫 CATCATCGGGAATGGCTTTTTGA
AATAAATAGCGCAAAATTAAGCA 285bp 44℃
早熟艾美耳球虫 TATTTCCTGTCGTCGTCTCGC
GTATGCAAGAGAGAATCGGGA 215bp 65℃
柔嫩艾美耳球虫 GATCAGTTTGAGCAAACCTTCG
TGGTCTTCCGTACGTCGGAT 271bp 65℃
PCR反应条件:94℃ 5min;94℃ 30s,65℃ 30s,72℃ 30s,35个循环;72℃ 10min
1. 2. 9 肠道组织PCR鉴定
1)称取0.6g的琼脂糖,用60ml的0.5×TAE电泳液配置成1%的琼脂糖,煮沸。
2)煮沸后冷却至60℃左右,加入6μL的核酸染料。
3)DL500 DNA Marker每孔加5μL,PCR产物每孔加10μL。
4)设置参数,盖上槽盖,接通电源开始跑胶。
5)将凝胶捞出进行凝胶成像。
2 结果与分析
2.1 肠道抹片观察结果
镜检显示:
感染后36小时可见游离的第一代裂殖子,位于卵黄囊憩室前10cm肠段的肠黏膜抹片中(图1)。
感染后48小时可见游离的第一代裂殖子,位于在卵黄囊憩室后5cm肠段的肠黏膜抹片中(图2)。
感染后60小时即可在所有肠段的肠黏膜抹片发现游离的裂殖子(图3、图4、图5)。
感染后100小时于卵黄囊憩室前10cm肠段的肠黏膜抹片中发现了卵囊(图6)。
感染后108小时在卵黄囊憩室后5cm肠段和盲肠盲端的肠黏膜抹片中可发现卵囊