还原性物质(Fe2+)添加对土壤微生物多样性的影响(3)

1.2 构建实验环境 向培养瓶中分别加入200 g的土样,加入100 mg/kg Fe2+溶液,然后加等量的去离子水,之后加水至高于土层3 cm,每个加入量三个重复分别命名


1.2 构建实验环境

向培养瓶中分别加入200 g的土样,加入100 mg/kg Fe2+溶液,然后加等量的去离子水,之后加水至高于土层3 cm,每个加入量三个重复分别命名为LCK1、LCK2、LCK3、LFe1、LFe2、LFe3,在25℃下培养25天。

1.3 土壤理化性质分析

具体步骤参见《土壤农业化学分析方法》[9]

1.4 微生物总DNA的提取与纯化

所有土壤样品均采用Omega公司的土壤微生物总DNA提取试剂盒提取土壤微生物总DNA[14],具体操作步骤参见试剂盒说明书,提取完毕用0.8% 的琼脂糖凝胶电泳检测DNA浓度,将提取DNA于-20℃保存备用。具体操作步骤如下:

1)称取0.5 g土壤样品于装有0.5 g玻璃珠的2 mL离心管中;

2)加入1 mL SLX-Mlus Buffer,以最大转速涡旋3-5 min;

3)加入100 μL DS Buffer,涡旋混匀样品;

4)70℃水浴10 min,颠倒混匀2次,95℃水浴2 min,3000 × g室温离心3 min;

5)将800 μL上清液转移至新的2 mL离心管中,加入270 μL P2 Buffer,充分混匀,冰浴5 min;

6)13000 ×g,4℃离心5 min,小心转移上清液至2 mL离心管中;

7)加入0.7倍体积的异丙醇,颠倒混匀20~30次;

8)13000 ×g,4℃离心10 min,弃上清液;

9)加入200 μL Elution Buffer混匀,70℃水浴10-20 min,溶解DNA沉淀;

10)加入100 μL HTR Reagent,充分混匀样品(HTR Reagent使用前需先混匀),室温静置2 min;

11)13000 ×g离心2 min,转移至新的2 mL离心管中(若上清液仍颜色很深,重复10-12步);

12)加入等体积的XP1 Buffer,混匀,将上清液转移至吸附柱中,10000×g室温离心1 min;

13)弃滤液,重复使用吸附柱,加300 μL XP1 Buffer,10000×g离心1 min,弃滤液,将吸附柱转移至新的2 mL离心管中;

14)加700 μL SPW Wash Buffer,10000×g离心1 min,弃滤液,重复2次;

15)13000×g室温空甩2 min,将吸附柱转移至新的1.5 mL离心管中;

16)加入30~100 μL Elution Buffer室温静置15 min,13000×g离心1 min,收集滤液即DNA,于-20℃保存。