1.1.2 载体 表 1-1 载体 名称 细菌选择性 植物选择性 pCAMBIA1305.1-GFP 卡那霉素(Kanamycin) 潮霉素(HygromycinB) pCAMBIA1381Z 卡那霉素(Kanamycin) 潮霉素(Hyg
1.1.2 载体
表 1-1 载体
名称 细菌选择性 植物选择性
pCAMBIA1305.1-GFP 卡那霉素(Kanamycin) 潮霉素(HygromycinB)
pCAMBIA1381Z 卡那霉素(Kanamycin) 潮霉素(HygromycinB)
1.1.3 菌株
表 1-2 菌株
名称 菌株类型 来源
大肠杆菌(Escherichia coli) DH5α 本实验室保存
农杆菌(Agrobacteriumtumefaciens) GV3101 本实验室保存
1.1.4试剂、酶及各种化学药品
1.1.4.1 抗生素(Antibiotics):
表 1-3 抗生素
名称 来源 溶剂 母液浓度 终浓度
潮霉素(HygromycinB,简写Hyg) Sigma 水 50mg/mL 25μg/mL
卡那霉素(Kanamycin,简写Kana) Roche 水 50mg/mL 50μg/mL
保存:-20℃冰箱
1.1.4.2 酶(Enzymes)
本实验中所使用的限制性内切酶、 RNase A 以及 RNA 反转录酶等为TaKaRa 产品;高保真 DNA 聚合酶购于 TOYOBO 公司; DNase I 为 Sigma 产品;T4-DNA 连接酶为 NEB 公司产品。
1.1.4.3 试剂盒、引物测序
质粒小提试剂盒在上海捷瑞生物公司购买。PCR产物回收试剂盒(DP204-03)为Takara公司产品。本课题中的引物合成服务以及序列测定服务均由司普金公司、生工生物公司提供。
1.1.5实验仪器
表 1-4 实验仪器
名称 型号
激光共聚焦显微镜 Carl Zeiss公司的LSM710
荧光显微镜 LEICA公司的Leitz DM2500型
凝胶成像系统 Bio-Rad公司的紫外扫描仪
普通离心机 Eppendorf公司的 5415D 型
低温离心机 Eppendorf公司的 5810R 型
电泳仪 北京六一厂生产
电泳槽 DYY-33A型 北京六一厂生产
PCR 仪 Bio-Rad公司的 PTC-100 型
1.2 方法
1.2.1 PCR法鉴定T-DNA插入突变体
1.2.1.1 Edwards 法提取DNA:
1.剪取 1-2 片适当大小的新鲜拟南芥叶片放置于 1.5mL 离心管中,每个离心管中加入 400µL 的爱德华缓冲液,放入小钢珠,在液氮下,摇晃离心管板将叶片研成匀浆;
2.常温下12000rpm 离心 5min;
3.弃沉淀,并将上清液倒入新的 1.5mL 离心管中,加入 400µL 异丙醇并混匀,在-20°C冰箱中放置 30min;
4.常温下12000rpm 离心 5min ,弃上清液;
5.向离心管中加入 400µL 70% 的乙醇,常温下12000rpm 离心 2min ,清洗沉淀,弃上清;
6.将离心管倒扣在吸水纸上沥干剩余的液体,离心管开盖正面朝上放置,在空气中干燥 10-15min;向离心管中加入 30µL 灭菌 dH2O,37°C下过夜,使溶解充分溶解后即可用于 PCR等实验。
1.2.1.2 三引物法鉴定VPS11纯合突变体:
1.构建PCR引物;
2.反应条件: 94°C ,5min;( 94°C ,30 sec,56°C ,30 sec;72°C ,1min) 35 个循环;72°C ,7 min;
3.分析:1.0% 琼脂糖胶电泳分析。