拟南芥HOPS复合体亚基突变体vps11+表型的初步鉴定(3)

1.1.2 载体 表 1-1 载体 名称 细菌选择性 植物选择性 pCAMBIA1305.1-GFP 卡那霉素(Kanamycin) 潮霉素(HygromycinB) pCAMBIA1381Z 卡那霉素(Kanamycin) 潮霉素(Hyg


1.1.2 载体

表 1-1 载体

名称 细菌选择性 植物选择性

pCAMBIA1305.1-GFP 卡那霉素(Kanamycin) 潮霉素(HygromycinB)

pCAMBIA1381Z 卡那霉素(Kanamycin) 潮霉素(HygromycinB)

1.1.3 菌株

表 1-2 菌株

名称 菌株类型 来源

大肠杆菌(Escherichia coli) DH5α 本实验室保存

农杆菌(Agrobacteriumtumefaciens) GV3101 本实验室保存

1.1.4试剂、酶及各种化学药品

1.1.4.1 抗生素(Antibiotics):

表 1-3 抗生素

名称 来源 溶剂 母液浓度 终浓度

潮霉素(HygromycinB,简写Hyg) Sigma 水 50mg/mL 25μg/mL

卡那霉素(Kanamycin,简写Kana) Roche 水 50mg/mL 50μg/mL

保存:-20℃冰箱

1.1.4.2 酶(Enzymes)

本实验中所使用的限制性内切酶、 RNase A 以及 RNA 反转录酶等为TaKaRa 产品;高保真 DNA 聚合酶购于 TOYOBO 公司; DNase I 为 Sigma 产品;T4-DNA 连接酶为 NEB 公司产品。

1.1.4.3 试剂盒、引物测序

质粒小提试剂盒在上海捷瑞生物公司购买。PCR产物回收试剂盒(DP204-03)为Takara公司产品。本课题中的引物合成服务以及序列测定服务均由司普金公司、生工生物公司提供。

1.1.5实验仪器

表 1-4 实验仪器

名称 型号

激光共聚焦显微镜 Carl Zeiss公司的LSM710

荧光显微镜 LEICA公司的Leitz DM2500型

凝胶成像系统 Bio-Rad公司的紫外扫描仪

普通离心机 Eppendorf公司的 5415D 型

低温离心机 Eppendorf公司的 5810R 型

电泳仪 北京六一厂生产

电泳槽 DYY-33A型 北京六一厂生产

PCR 仪 Bio-Rad公司的 PTC-100 型

1.2 方法

1.2.1 PCR法鉴定T-DNA插入突变体

1.2.1.1 Edwards 法提取DNA:

1.剪取 1-2 片适当大小的新鲜拟南芥叶片放置于 1.5mL 离心管中,每个离心管中加入 400µL 的爱德华缓冲液,放入小钢珠,在液氮下,摇晃离心管板将叶片研成匀浆;

2.常温下12000rpm 离心 5min;

3.弃沉淀,并将上清液倒入新的 1.5mL 离心管中,加入 400µL 异丙醇并混匀,在-20°C冰箱中放置 30min;

4.常温下12000rpm 离心 5min ,弃上清液;

5.向离心管中加入 400µL 70% 的乙醇,常温下12000rpm 离心 2min ,清洗沉淀,弃上清;

6.将离心管倒扣在吸水纸上沥干剩余的液体,离心管开盖正面朝上放置,在空气中干燥 10-15min;向离心管中加入 30µL 灭菌 dH2O,37°C下过夜,使溶解充分溶解后即可用于 PCR等实验。

1.2.1.2 三引物法鉴定VPS11纯合突变体:

1.构建PCR引物;

2.反应条件: 94°C ,5min;( 94°C ,30 sec,56°C ,30 sec;72°C ,1min) 35 个循环;72°C ,7 min;

3.分析:1.0% 琼脂糖胶电泳分析。