麦草畏降解菌株的筛选和鉴定(3)

1.1.1 培养基与试剂 配置5000 mg/L的麦草畏原药。无机盐培养基MM (g/L):KH2PO4 0.5,K2HPO4 1.5,NaCl 0.5,NH4NO3 1.5,MgSO4·7H2O 0.2,去离子水1000 mL,pH 7.0。富集及


1.1.1 培养基与试剂 配置5000 mg/L的麦草畏原药。无机盐培养基MM (g/L):KH2PO4 0.5,K2HPO4 1.5,NaCl 0.5,NH4NO3 1.5,MgSO4·7H2O 0.2,去离子水1000 mL,pH 7.0。富集及分离培养基:在每100 mL的MM培养基中加入2 mL的麦草畏原药作为唯一碳源,培养基中麦草畏浓度为100 mg/L。全营养培养基LB(g/L):蛋白胨10.0,酵母膏5.0,NaCl 10.0,去离子水1000 mL,pH 7.0。固体培养基,在液体培养基中每1000 mL再加入15 g琼脂。

1.1.2 富集传代培养 在含100 mg/L麦草畏的无机盐培养基中分别加入10 g取自烟草地和低盐地的土壤样品,封口,标记,于30℃,振荡培养,同时制作对照(CK),用灭菌后的含100 mg/L麦草畏的无机盐培养基作为对照。7天后,吸取富集液的上清液,离心,用紫外分光光度计来检测麦草畏的利用率,无机盐溶液作为基准,扫描波长为200-350 nm,麦草畏的吸收峰约为275 nm。同时取2 mL接种到经过灭菌的新的含100 mg/L麦草畏的无机盐培养基,标记后继续振荡培养。7天后继续检测麦草畏的利用率同时传代,以相同条件培养,连续重复5次。

1.1.3 稀释涂布 经过多次重复尝试,除了最初的烟草地样品的富集液,传代培养基均没有发现明显的吸光度变化,再次将烟草地样品进行传代接种依旧没有明显变化。于是将最初的烟草地富集液与最终的传代培养基进行涂布。将培养基按梯度稀释到10-7倍,各取10-3,10-4,10-5,10-6,10-7,五个梯度进行涂布分离,涂布到麦草畏浓度为200 mg/L的固体无机盐培养基,将涂布好的平板放到30℃恒温培养箱培养5天,观察是否形成单菌落。选取两株清晰的单菌落接种到LB培养基进行培养。并将其命名为Dicamba-1和Dicamba-2。

1.1.4 紫外检测 选择清晰的单菌落,将分离得到的两种菌接种到麦草畏浓度为100 mg/L的液体MM培养基中进行培养。每天对其进行吸光度的检测,持续5天,发现吸光度并没有发生变化,得出该两种菌为耐药菌不具有降解麦草畏的能力。

1.2 菌种鉴定

将在LB培养基中培养的菌种划线到固体LB培养基上观察菌落形状、大小、颜色、透明度、边缘整齐度、湿润度和表面隆起等特征,进行革兰氏染色。再通过测定16S rRNA的序列确定它的遗传学地位。

1.2.1 革兰氏染色

(1)涂片固定。

(2)草酸铵结晶紫染1分钟。

(3)自来水冲洗。

(4)加碘液覆盖涂面染约1分钟。

(5)水洗,用吸水纸吸去水分。

(6)加95%酒精数滴,并轻轻摇动进行脱色,20秒后水洗,吸去水分。

(7)蕃红染色液(稀)染2分钟后,自来水冲洗.干燥,镜检。

1.2.2 用CTAB法提取总DNA

CTAB作为一种阳离子去污剂,可溶解细胞膜,与核酸形成复合物,可使核酸沉淀出来。

(1)吸取2 mL经过扩大培养后的菌液至离心管,12000 rpm 高速离心后去上清,来收集菌体。

(2)加入3~5 mL TEN 洗涤,再经过高速离心后,重悬于2 mL TEN中,洗去杂质。

(3)加入15 μL溶菌酶,在55℃恒温水浴2小时,来破碎细胞。

(4)加入200 μL SDS 溶液后再55℃水浴30 min 来使得蛋白沉淀析出。十二烷基硫酸钠(SDS)是一种常用的离子型去垢剂,可使细胞膜崩解,与膜蛋白的疏水部分进行结合并使其与膜分离,高浓度的SDS还能够破坏蛋白质中的离子键和氢键等非共价键,甚至可以改变蛋白质的构象。

(5)加入15 μL 蛋白酶K 溶液,65 ℃水浴几小时至溶液澄清,以除去组蛋白。

(6)加入500 μL 饱和NaCl 和150 μL CTAB/NaCl 溶液,65℃水浴10 min,12000 rpm,离心5 min,将CTAB-核酸的复合物与蛋白、多糖类物质分开。

(7)再在其中加入等体积的酚:氯仿,抽提1~2 次12000 rpm 离心5 min,至上清中不含蛋白残留物,收集上清。