从森林草莓基因组中鉴定到了12个SWEET 基因,并对其进行了进化分析发现在森林草莓与拟南芥、水稻等植物中的SWEET基因具有很高的同源性
摘要: SWEET基因家族编码一类含有两个MtN3/saliva结构域的七次跨膜螺旋的膜包埋糖转运蛋白,在原核、真核生物中均广泛存在。植物SWEET基因家族参与生殖发育、衰老、逆境响应等多个生理过程。但在草莓中其生理功能尚不清楚,本研究中,我们从森林草莓中鉴定到了12个SWEET基因,并对其进行了命名。序列分析表明草莓SWEET基因与拟南芥、水稻等模式植物中的SWEET基因高度同源,同样可以分为四个亚家族,表达分析发现,除了FvSWEET1、2、6在所有检测组织中表达量较高外,其他FvSWEET基因的表达量均较低,我们进一步克隆了FvSWEET4,FvSWEET5这两个基因并构建了它们的遗传转化载体,为将来的功能验证奠定了基础。
关键词:森林草莓 SWEET 基因表达 基因
Molecular Cloning and Analysis of SWEET Gene Family in Woodland strawberry Fragaria vesca
Abstract:The Sugars Will Eventually be Exported Transporters (SWEET) gene family encodes membrane-embedded sugar transporters that containing seven transmembrane helices harboring two MtN3 and saliva domains, which are widely present in both prokaryotic and eukaryotic organisms. In model plants, SWEET genes were involved in various aspects regulation such as, reproductive organs development, senescence, environment stimulation responses. However, in Woodland strawberry Fragaria vesca, the functions of SWEETs are not clear. In this study, we identified and annotated 12 SWEET genes in the woodland strawberry. Sequence analysis indicated that the SWEET genes of woodland strawberry showed high similarity to their homologous in Arabidopsis and rice, which could be pided into four subfamilies. The expression analysis showed FvSWEET1, 2, 6 were highly expressed in all detected tissues, contrast to the other FvSWEETs. Finally we cloned FvSWEET4 and FvSWEET5 and generated overexpression vectors of the two genes for future plant transformation. This study laid the foundation for further functional verification of FvSWEETs.
Keywords:Fragaria vesca; SWEET; Gene Expression; Gene
草莓SWEET基因家族成员的分析与克隆定
摘要2
关键词2
Abstract2
Key words2
引言2
1材料与方法4
1.1实验材料 4
1.2实验方法 4
1.2.1 数据检索4
1.2.2 草莓SWEET基因的鉴定4
1.2.3森林草莓SWEET的蛋白序列进化分析4
1.2.4 SWEET在森林草莓各组织中的表达4
1.2.5森林草莓总RNA的提取与反转录4
1.2.6森林草莓SWEET基因的克隆5
1.2.7载体的构建5
2结果与分析6
2.1森林草莓SWEET基因家族信息6
2.2森林草莓SWEET基因家族的进化分析7
2.2.1 SWEET 基因 A1 亚族分析7
2.2.1 SWEET 基因 A2 亚族分析7
2.2.1 SWEET 基因 A3 亚族分析7
2.2.1 SWEET 基因 B1 亚族系统进化分析8
2.3 森林草莓的SWEET基因在各组织中表达分析10
2.4森林草莓的SWEET基因克隆10
2.5 森林草莓的SWEET基因过量表达载体构建11
3讨论11
致谢12
参考文献12
草莓SWEET基因家族成员的分析与克隆鉴定
引言 能够通过光合作用将大气中的二氧化碳等无机物同化为糖等有机物是自养生物区别于异养生物的主要特征,而光合作用的主要产物之一蔗糖既是植物自身生长所需的能量物质,也是其它异养生物摄取的重要能源物质。叶片中合成的蔗糖除了少部分提供植物生长外,大部分都被存储在种子、果实、块根或块茎等部位。蔗糖从合成的“源”存储的“库”由由3个阶段组成:1,蔗糖的装载阶段,蔗糖由合成的细胞通过糖转运载体转移到韧皮部;2,蔗糖的运输,再通过筛管的韧皮部细胞将蔗糖运输到存储组织;3,蔗糖的卸载,到达存储组织后蔗糖再通过糖转运蛋白从韧皮部卸载,再进一步合成淀粉或其它有机物存储起来。